Věda vstupuje do své agentické éry Představujeme mapu vědeckého ekosystému umělé inteligence! 🗺️ Zmapovali jsme nástroje, modely a agentické rámce pohánějící nový substrát pro bio Vytvořeno, aby pomohlo zakladatelům, výzkumníkům a stavitelům orientovat se v explozi vědecké umělé inteligence Pojďme si to rozebrat🧵

Vědečtí agenti umělé inteligence už nejsou sci-fi 👾 Mohou: → Souhrnný výzkum SOTA → Formulovat vědecké hypotézy → Navrhovat a provádět experimenty Ale každá laboratoř se staví v silech. Proto vidíme jasnou potřebu přidat k tomu, co svět agentické vědy web2 vytváří.

Za tímto účelem přichází éra "kolektivní vědecké inteligence". Od dolování literatury až po automatizaci laboratoří jsme zmapovali 5 klíčových vrstev, které pohánějí vědeckou umělou inteligenci a posouvají prostor biologického designu👇

1. Znalosti a zdroje dat Vše začíná daty. Vědečtí agenti čerpají z: • PubMed, Dataverse (články a akademická data) • PDB, UniProt (proteiny) • ChEMBL, PubChem (chemie) • Reactome, genová ontologie (dráhy) • AACT (klinická hodnocení) • @biorxivpreprint (preprinty)

2. Vrstvy agentické orchestrace Tyto nástroje přivádějí uvažování k životu. Příklady: • @ElizaEcoFund - plug-and-play agent framework • ChemCrow - asistent chemie • BioMCP / PubMedMCP - literatura servery • "Coscientist" - autonomní laboratorní agent • @PrimeIntellect - modulární agent infra

3. Modely založení a domény Vysokooktanoví dříči. Příklady: • AlphaFold 2 - predikce struktury • Evo 2 - genomické modelování (Arc Institute) • Geneformer - genová exprese • ChemGPT - chemické uvažování • ESM-3, PaLM-2, Claude 3 - jazykové kostry

4. Provedení experimentu a simulace Experimenty s umělou inteligencí. Mezi systémy patří: • Opentrony - laboratorní roboti řízení API • INDRA - mechanické modelování • PyMOL / AlphaFold inference • Cloudová simulace: OpenMM, Foldit • SMART-on-FHIR: včasná integrace EHR

5. Platformy a asistenti orientovaní na vědce Kde se umělá inteligence setkává s výzkumníky. • @GoogleAI Co-Scientist - brainstorming hypotéz • @FutureHouseSF - Q&A, systematické přehledy, plánování chemie • Consensus & Elicit - recenze strukturovaných článků • Biomni, Iris, Scite - specializovaní papírenští agenti • @vita_dao AUBRAI, ChatPaper - AI research co-pilots

Společně tyto nástroje tvoří nový výzkumný stack: → modely interpretují biologii → Agenti orchestrují uvažování → Platformy poskytují pomoc → Robotika a simulace uzavírají smyčku

Mapa vědeckého ekosystému umělé inteligence není jen seznam nástrojů. Je to plán na bio/acc 🧪 Od vyhledávání → k syntéze Od analýzy → k akci Od statických znalostí → k systémům, které se učí