A ciência está a entrar na sua Era Agente Apresentamos o Mapa do Ecossistema de IA Científica! 🗺️ Mapeámos as ferramentas, modelos e estruturas agentes que alimentam o novo substrato para a biologia Construído para ajudar fundadores, investigadores e construtores a navegar na explosão da IA científica Vamos analisar isso🧵

Agentes de IA científica já não são ficção científica 👾 Eles podem: → Agregar pesquisas de SOTA → Formular hipóteses científicas → Projetar e executar experimentos Mas cada laboratório está construindo em silos. É por isso que vemos uma necessidade clara de adicionar ao que o mundo da Ciência Agente web2 está criando.

Para esse fim, a era da 'inteligência científica coletiva' está a chegar. Desde a mineração de literatura até à automação de laboratórios, mapeámos as 5 camadas-chave que impulsionam a IA científica e avançam o espaço de design biológico👇

1. Conhecimento & Fontes de Dados Tudo começa com dados. Agentes científicos extraem de: • PubMed, Dataverse (artigos e dados académicos) • PDB, UniProt (proteínas) • ChEMBL, PubChem (química) • Reactome, Gene Ontology (vias) • AACT (ensaios clínicos) • @biorxivpreprint (pré-publicações)

2. Camadas de Orquestração Agente Estas ferramentas trazem o raciocínio à vida. Exemplos: • @ElizaEcoFund - estrutura de agente plug-and-play • ChemCrow - assistente de química • BioMCP / PubMedMCP - servidores de literatura • “Coscientist” - agente de laboratório autónomo • @PrimeIntellect - infraestrutura de agente modular

3. Modelos de Fundação e Domínio Os trabalhadores de alta octanagem. Exemplos: • AlphaFold 2 - previsão de estrutura • Evo 2 - modelagem genómica (Arc Institute) • Geneformer - expressão genética • ChemGPT - raciocínio químico • ESM-3, PaLM-2, Claude 3 - estruturas linguísticas

4. Execução de Experimentos e Simulações IA a realizar experimentos. Os sistemas incluem: • Opentrons - robôs de laboratório acionados por API • INDRA - modelagem mecanicista • Inferência PyMOL / AlphaFold • Simulação baseada na nuvem: OpenMM, Foldit • SMART-on-FHIR: integração inicial de EHR

5. Plataformas e Assistentes Voltados para Cientistas Onde a IA encontra os pesquisadores. • @GoogleAI Co-Cientista - brainstorming de hipóteses • @FutureHouseSF - Perguntas e Respostas, revisões sistemáticas, planejamento químico • Consensus & Elicit - revisões estruturadas de artigos • Biomni, Iris, Scite - agentes especializados em artigos • @vita_dao AUBRAI, ChatPaper - co-pilotos de pesquisa em IA

Juntos, estas ferramentas formam uma nova pilha de pesquisa: → Modelos interpretam a biologia → Agentes orquestram o raciocínio → Plataformas oferecem assistência → Robótica e simulação fecham o ciclo

O Mapa do Ecossistema Científico de IA não é apenas uma lista de ferramentas. É um plano para bio/acc 🧪 Da pesquisa → à síntese Da análise → à ação Do conhecimento estático → a sistemas que aprendem