Sains memasuki Era Agen Memperkenalkan Peta Ekosistem AI Ilmiah! 🗺️ Kami memetakan alat, model & kerangka kerja agen yang mendukung substrat baru untuk bio Dibangun untuk membantu pendiri, peneliti & pembangun menavigasi ledakan AI ilmiah Mari kita uraikan🧵
Agen AI ilmiah bukan lagi sci-fi 👾 Mereka dapat: → Penelitian SOTA Agregat → Merumuskan hipotesis ilmiah → Merancang dan menjalankan eksperimen Tetapi setiap laboratorium membangun silo. Itu sebabnya kami melihat kebutuhan yang jelas untuk menambahkan apa yang diciptakan dunia Ilmu Agen web2.
Untuk itu, era 'kecerdasan ilmiah kolektif' tiba. Dari penambangan literatur hingga otomatisasi lab, kami telah memetakan 5 lapisan kunci yang mendukung AI ilmiah dan memajukan ruang👇 desain biologis
1. Pengetahuan & Sumber Data Semuanya dimulai dengan data. Agen ilmiah menarik dari: • PubMed, Dataverse (makalah & data akademik) • PDB, UniProt (protein) • ChEMBL, PubChem (kimia) • Reaktome, Ontologi Gen (jalur) • AACT (uji klinis) • @biorxivpreprint (pracetak)
2. Lapisan Orkestrasi Agen Alat-alat ini menghidupkan penalaran. Contoh: • @ElizaEcoFund - kerangka kerja agen plug-and-play • ChemCrow - asisten kimia • BioMCP / PubMedMCP - server literatur • "Coscientist" - agen lab otonom • @PrimeIntellect - agen modular infra
3. Model Yayasan & Domain Pekerja keras beroktan tinggi. Contoh: • AlphaFold 2 - prediksi struktur • Evo 2 - pemodelan genomik (Arc Institute) • Geneformer - ekspresi gen • ChemGPT - penalaran kimia • ESM-3, PaLM-2, Claude 3 - perancah bahasa
4. Eksekusi Eksperimen & Simulasi AI menjalankan eksperimen. Sistem meliputi: • Opentrons - robot lab berbasis API • INDRA - pemodelan mekanistik • Inferensi PyMOL / AlphaFold • Simulasi berbasis cloud: OpenMM, Foldit • SMART-on-FHIR: integrasi EHR awal
5. Platform & Asisten yang Menghadap Ilmuwan Di mana AI bertemu dengan peneliti. • @GoogleAI Co-Scientist - brainstorming hipotesis • @FutureHouseSF - Tanya Jawab, tinjauan sistematis, perencanaan kimia • Konsensus & Elicit - ulasan makalah terstruktur • Biomni, Iris, Scite - agen kertas khusus • @vita_dao AUBRAI, ChatPaper - Co-pilot penelitian AI
Bersama-sama, alat-alat ini membentuk tumpukan penelitian baru: Model → menafsirkan biologi → Agen mengatur penalaran Platform → memberikan bantuan → Robotika dan simulasi menutup lingkaran
Peta Ekosistem AI Ilmiah bukan hanya daftar alat. Ini adalah cetak biru untuk bio/acc 🧪 Dari → pencarian hingga sintesis Dari → analisis hingga tindakan Dari → pengetahuan statis hingga sistem yang belajar
9,99K